一、RNAi技術(shù)原理
RNA干擾(RNA interference,RNAi)現(xiàn)象是指內(nèi)源性或外源性雙鏈RNA (dsRNA) 介導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)mRNA發(fā)生特異性降解,導(dǎo)致靶基因的表達(dá)沉默,產(chǎn)生相應(yīng)的功能表型缺失。這一現(xiàn)象屬于轉(zhuǎn)錄后的基因沉默機(jī)制 (Posttranscriptional gene silencing,PTGS)。短片段的雙鏈RNA在體內(nèi)能在酶(Dicer)及相關(guān)復(fù)合物(RISC)的作用下,變成單鏈分子,并與目標(biāo)基因mRNA互補(bǔ),在Dicer酶作用下,使mRNA發(fā)生剪切,轉(zhuǎn)錄受抑制或翻譯受到抑制,從而在轉(zhuǎn)錄水平或轉(zhuǎn)錄后水平干擾基因表達(dá)。
研究表明,RNAi可能的作用途徑大致可分為兩種:一種是以線蟲、真菌和植物為代表的RdRp(RNA-dependent RNA polymerase)途徑。RNAi現(xiàn)象有一個(gè)靶RNA的大量產(chǎn)生過程,產(chǎn)生的靶RNA在Dicer的進(jìn)一步作用下, 產(chǎn)生大量的siRNA,達(dá)到有效濃度的siRNA能夠啟動(dòng)RNAi機(jī)制,降解靶mRNA;另一種途徑以果蠅和哺乳動(dòng)物細(xì)胞為代表,外源或內(nèi)源的雙鏈RNA在Dicer的切割下生成siRNA,這些siRNA與其他蛋白質(zhì)形成RISC(RNA-induced silencing complex)結(jié)構(gòu),能夠識別切割靶mRNA分子。RNAi現(xiàn)象除了使生物體擁有抗病毒、穩(wěn)定轉(zhuǎn)座子和參與胚胎發(fā)育的生物學(xué)功能外,還可作為未知功能基因的逆向遺傳學(xué)的研究手段。目前,RNAi已成為哺乳動(dòng)物基因功能研究的重要方法。
二、RNAi實(shí)驗(yàn)流程
● 設(shè)計(jì)siRNA
● 合成siRNA
● 將siRNA導(dǎo)入細(xì)胞
● 監(jiān)測RNAi效果
反義寡核苷酸技術(shù)
DNA上攜帶有編碼蛋白質(zhì)的氨基酸信息的核酸序列的鏈,稱為正義鏈(senses trand);另一條鏈的核苷酸序列與正義鏈互補(bǔ),稱為反義鏈(antisensestrand)。所謂反義寡核苷酸(antisense oligo-deoxyribonucleotide,AS-ODN)又稱“反義核酸”,即為人工合成長度為10-30個(gè)堿基的DNA分子及其類似物,通過Watson-Crick堿基配對,與靶基因mRNA(正義鏈)上的特定序列雜交,從而抑制蛋白質(zhì)的表達(dá)。
反義寡核苷酸包括反義DNA、反義RNA和酶性RNA。作用原理是:①AS-ODNs與DNA結(jié)合,抑制DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄;②AS-ODNs與mRNA前體結(jié)合,阻斷RNA加工、成熟,影響核糖體沿mRNA移動(dòng);③激活RNase剪切雜交鏈中未配對的堿基。
反義寡核苷酸技術(shù)具有明顯的優(yōu)點(diǎn):
(1)反義核酸是針對特定的靶mRNA(DNA)的序列,基因序列已知;
(2)反義核酸僅有15-30個(gè)堿基,結(jié)構(gòu)簡單,容易設(shè)計(jì)和體外大量合成。
(3)反義核酸進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與細(xì)胞周期無關(guān),既可進(jìn)入增殖期細(xì)胞又可進(jìn)入非增殖期細(xì)胞。
反義寡核苷酸技術(shù)主要應(yīng)用于基因的功能研究,以及臨床的基因治療。
三、樣本準(zhǔn)備
源基因樣本
四、BG為您提供以下服務(wù)
● 設(shè)計(jì)并合成干擾siRNA序列,設(shè)計(jì)并合成正義及反義寡核苷酸序列;
● 獲得siRNA核酸或構(gòu)建siRNA表達(dá)載體;
● 根據(jù)您的要求進(jìn)一步轉(zhuǎn)染哺乳動(dòng)物細(xì)胞;
● 檢測抑制效果:熒光定量PCR檢測mRNA表達(dá)情況、Western Blot、IHC檢測蛋白表達(dá)情況。
● 提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告:siRNA序列、反義寡核苷酸序列、構(gòu)建載體的測序報(bào)告;熒光定量PCR檢測報(bào)告、Western Blot及IHC圖片等。
◆ 特別說明
我們盡量優(yōu)化選擇靶位點(diǎn),由于并不是每個(gè)siRNA都能有效抑制目的基因表達(dá),一般建議您設(shè)計(jì)三個(gè)或三個(gè)以上序列。
本試驗(yàn)收費(fèi)情況請電話垂詢。